暗号化ファイルに有効期限を設定できますか。その場合、有効期限が過ぎたファイルをどうしても利用したい場合はどうなりますか。

ファイルの暗号化時に有効期間を設定する事が可能です。
有効期間から外れた暗号化ファイルは、閲覧や更新を行う事はできません。
ただし、復号は有効期間に関係なく行う事ができますので、適切な権限を持ったユーザによる復号操作により平文の状態に戻す事ができます。
なお既に暗号化されているファイルに有効期間を設定したい場合は一旦復号し、有効期間を設定した上で、再度暗号化を行います。